МСЧ-25 действует по территориальному принципу, независимо от ГУФСИН России по Приморскому краю и непосредственно подчинено ФСИН России. Учреждение осуществляет прямое руководство всем медико-санитарным обеспечением сотрудников и пенсионеров УИС Приморского края, членов их семей, подозреваемых, обвиняемых и осужденных, а также контроль за санитарно–эпидемиологическим состоянием объектов УИС Приморского края и ДФО.